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废水数据显示,Omicron 可能早在美国发现第一例病例之前就已经在纽约市了
根据疾病控制与预防中心和全国研究人员的一份新报告, Omicron 可能在美国发现第一例新变种前一周多就存在于纽约市的废水中。
样本表明,纽约市的某人可能早在 11 月 21 日就感染了 Omicron 变体,比南非科学家首次宣布该变体病例早四天,比美国报告第一例病例早十天。加利福尼亚州和德克萨斯州的研究人员还在 11 月下旬的废水样本中发现了 Omicron 的证据。
研究结果表明,当时 Omicron 变体在美国比单独的病例数据所表明的更为普遍,并提供了更多证据表明废水监测可以作为新变体传播的早期预警系统。
“起初,不确定这种变体是否会来到美国,”斯坦福大学的环境工程师、该论文的作者 Alexandria Boehm 说。“废水在临床样本之前回答了这个问题,答案是肯定的。”
该研究没有提供确凿的证据表明 Omicron 存在于这些城市。废水中存在的病毒是碎片化的,虽然研究人员检测到了 Omicron 的许多明显突变,但这些发现并不能证明它们都存在于同一个基因组上。
CDC国家废水监测系统项目负责人、《Omicron纸。
“我认为看到一个新的变种首先出现在像纽约这样的大城市,我认为没有人会感到惊讶,”她说。
来自多个机构的科学家团队——皇后学院的 John Dennehy、皇后区社区学院的 Monica Trujillo、德克萨斯 A&M 大学的 Davida Smyth 和密苏里大学的 Marc Johnson——自今年夏天以来一直在追踪纽约市废水中的冠状病毒。 2020. 该团队通常每周收集样本,然后对他们发现的病毒进行测序。
科学家们于 11 月 21 日收集了一份常规样本,两天后将其送去测序。Dennehy 博士说,当他们在 12 月初得到结果时,Omicron 的消息已经传出,他们“立即认识到”新变体的明显突变。
Boehm 博士的团队在加利福尼亚采取了不同的方法,使用能够检测 Omicron 的某些特定突变的 PCR 测试。Boehm 博士说,他们在 11 月 26 日从前一天在默塞德收集的样本中获得了第一次打击。他们于 11 月 30 日在萨克拉门托收集了另一个样本。
12月1日宣布了美国首例确诊的Omicron病例。
“我们的周转速度非常快,采样频率非常高,”Boehm 博士说。她补充说,“这只是比临床测序更早地提供信息。”
Emily Anthes 是《纽约时报》的记者,她专注于科学和健康,涵盖冠状病毒大流行、疫苗接种、病毒检测和儿童 Covid 等主题。
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废水数据显示,Omicron 可能早在美国发现第一例病例之前就已经在纽约市了
根据疾病控制与预防中心和全国研究人员的一份新报告, Omicron 可能在美国发现第一例新变种前一周多就存在于纽约市的废水中。
样本表明,纽约市的某人可能早在 11 月 21 日就感染了 Omicron 变体,比南非科学家首次宣布该变体病例早四天,比美国报告第一例病例早十天。加利福尼亚州和德克萨斯州的研究人员还在 11 月下旬的废水样本中发现了 Omicron 的证据。
研究结果表明,当时 Omicron 变体在美国比单独的病例数据所表明的更为普遍,并提供了更多证据表明废水监测可以作为新变体传播的早期预警系统。
“起初,不确定这种变体是否会来到美国,”斯坦福大学的环境工程师、该论文的作者 Alexandria Boehm 说。“废水在临床样本之前回答了这个问题,答案是肯定的。”
该研究没有提供确凿的证据表明 Omicron 存在于这些城市。废水中存在的病毒是碎片化的,虽然研究人员检测到了 Omicron 的许多明显突变,但这些发现并不能证明它们都存在于同一个基因组上。
CDC国家废水监测系统项目负责人、《Omicron纸。
“我认为看到一个新的变种首先出现在像纽约这样的大城市,我认为没有人会感到惊讶,”她说。
来自多个机构的科学家团队——皇后学院的 John Dennehy、皇后区社区学院的 Monica Trujillo、德克萨斯 A&M 大学的 Davida Smyth 和密苏里大学的 Marc Johnson——自今年夏天以来一直在追踪纽约市废水中的冠状病毒。 2020. 该团队通常每周收集样本,然后对他们发现的病毒进行测序。
科学家们于 11 月 21 日收集了一份常规样本,两天后将其送去测序。Dennehy 博士说,当他们在 12 月初得到结果时,Omicron 的消息已经传出,他们“立即认识到”新变体的明显突变。
Boehm 博士的团队在加利福尼亚采取了不同的方法,使用能够检测 Omicron 的某些特定突变的 PCR 测试。Boehm 博士说,他们在 11 月 26 日从前一天在默塞德收集的样本中获得了第一次打击。他们于 11 月 30 日在萨克拉门托收集了另一个样本。
12月1日宣布了美国首例确诊的Omicron病例。
“我们的周转速度非常快,采样频率非常高,”Boehm 博士说。她补充说,“这只是比临床测序更早地提供信息。”
Emily Anthes 是《纽约时报》的记者,她专注于科学和健康,涵盖冠状病毒大流行、疫苗接种、病毒检测和儿童 Covid 等主题。
#N.Y.C. wastewater Omicron
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废水数据显示,Omicron 可能早在美国发现第一例病例之前就已经在纽约市了
废水数据显示,Omicron 可能早在美国发现第一例病例之前就已经在纽约市了 根据疾病控制与预防中心和全国研究人员的一份新报告, Omicron 可能在美国发现第一例新变种前一周多就存在于纽约市的废水中。
样本表明,纽约市的某人可能早在 11 月 21 日就感染了 Omicron 变体,比南非科学家首次宣布该变体病例早四天,比美国报告第一例病例早十天。加利福尼亚州和德克萨斯州的研究人员还在 11 月下旬的废水样本中发现了 Omicron 的证据。
研究结果表明,当时 Omicron 变体在美国比单独的病例数据所表明的更为普遍,并提供了更多证据表明废水监测可以作为新变体传播的早期预警系统。
“起初,不确定这种变体是否会来到美国,”斯坦福大学的环境工程师、该论文的作者 Alexandria Boehm 说。“废水在临床样本之前回答了这个问题,答案是肯定的。”
该研究没有提供确凿的证据表明 Omicron 存在于这些城市。废水中存在的病毒是碎片化的,虽然研究人员检测到了 Omicron 的许多明显突变,但这些发现并不能证明它们都存在于同一个基因组上。
CDC国家废水监测系统项目负责人、《Omicron纸。
“我认为看到一个新的变种首先出现在像纽约这样的大城市,我认为没有人会感到惊讶,”她说。
来自多个机构的科学家团队——皇后学院的 John Dennehy、皇后区社区学院的 Monica Trujillo、德克萨斯 A&M 大学的 Davida Smyth 和密苏里大学的 Marc Johnson——自今年夏天以来一直在追踪纽约市废水中的冠状病毒。 2020. 该团队通常每周收集样本,然后对他们发现的病毒进行测序。
科学家们于 11 月 21 日收集了一份常规样本,两天后将其送去测序。Dennehy 博士说,当他们在 12 月初得到结果时,Omicron 的消息已经传出,他们“立即认识到”新变体的明显突变。
Boehm 博士的团队在加利福尼亚采取了不同的方法,使用能够检测 Omicron 的某些特定突变的 PCR 测试。Boehm 博士说,他们在 11 月 26 日从前一天在默塞德收集的样本中获得了第一次打击。他们于 11 月 30 日在萨克拉门托收集了另一个样本。
12月1日宣布了美国首例确诊的Omicron病例。
“我们的周转速度非常快,采样频率非常高,”Boehm 博士说。她补充说,“这只是比临床测序更早地提供信息。”
Emily Anthes 是《纽约时报》的记者,她专注于科学和健康,涵盖冠状病毒大流行、疫苗接种、病毒检测和儿童 Covid 等主题。
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废水数据显示,Omicron 可能早在美国发现第一例病例之前就已经在纽约市了
根据疾病控制与预防中心和全国研究人员的一份新报告, Omicron 可能在美国发现第一例新变种前一周多就存在于纽约市的废水中。
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研究结果表明,当时 Omicron 变体在美国比单独的病例数据所表明的更为普遍,并提供了更多证据表明废水监测可以作为新变体传播的早期预警系统。
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该研究没有提供确凿的证据表明 Omicron 存在于这些城市。废水中存在的病毒是碎片化的,虽然研究人员检测到了 Omicron 的许多明显突变,但这些发现并不能证明它们都存在于同一个基因组上。
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根据疾病控制与预防中心和全国研究人员的一份新报告, Omicron 可能在美国发现第一例新变种前一周多就存在于纽约市的废水中。
样本表明,纽约市的某人可能早在 11 月 21 日就感染了 Omicron 变体,比南非科学家首次宣布该变体病例早四天,比美国报告第一例病例早十天。加利福尼亚州和德克萨斯州的研究人员还在 11 月下旬的废水样本中发现了 Omicron 的证据。
研究结果表明,当时 Omicron 变体在美国比单独的病例数据所表明的更为普遍,并提供了更多证据表明废水监测可以作为新变体传播的早期预警系统。
“起初,不确定这种变体是否会来到美国,”斯坦福大学的环境工程师、该论文的作者 Alexandria Boehm 说。“废水在临床样本之前回答了这个问题,答案是肯定的。”
该研究没有提供确凿的证据表明 Omicron 存在于这些城市。废水中存在的病毒是碎片化的,虽然研究人员检测到了 Omicron 的许多明显突变,但这些发现并不能证明它们都存在于同一个基因组上。
CDC国家废水监测系统项目负责人、《Omicron纸。
“我认为看到一个新的变种首先出现在像纽约这样的大城市,我认为没有人会感到惊讶,”她说。
来自多个机构的科学家团队——皇后学院的 John Dennehy、皇后区社区学院的 Monica Trujillo、德克萨斯 A&M 大学的 Davida Smyth 和密苏里大学的 Marc Johnson——自今年夏天以来一直在追踪纽约市废水中的冠状病毒。 2020. 该团队通常每周收集样本,然后对他们发现的病毒进行测序。
科学家们于 11 月 21 日收集了一份常规样本,两天后将其送去测序。Dennehy 博士说,当他们在 12 月初得到结果时,Omicron 的消息已经传出,他们“立即认识到”新变体的明显突变。
Boehm 博士的团队在加利福尼亚采取了不同的方法,使用能够检测 Omicron 的某些特定突变的 PCR 测试。Boehm 博士说,他们在 11 月 26 日从前一天在默塞德收集的样本中获得了第一次打击。他们于 11 月 30 日在萨克拉门托收集了另一个样本。
12月1日宣布了美国首例确诊的Omicron病例。
“我们的周转速度非常快,采样频率非常高,”Boehm 博士说。她补充说,“这只是比临床测序更早地提供信息。”
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根据疾病控制与预防中心和全国研究人员的一份新报告, Omicron 可能在美国发现第一例新变种前一周多就存在于纽约市的废水中。
样本表明,纽约市的某人可能早在 11 月 21 日就感染了 Omicron 变体,比南非科学家首次宣布该变体病例早四天,比美国报告第一例病例早十天。加利福尼亚州和德克萨斯州的研究人员还在 11 月下旬的废水样本中发现了 Omicron 的证据。
研究结果表明,当时 Omicron 变体在美国比单独的病例数据所表明的更为普遍,并提供了更多证据表明废水监测可以作为新变体传播的早期预警系统。
“起初,不确定这种变体是否会来到美国,”斯坦福大学的环境工程师、该论文的作者 Alexandria Boehm 说。“废水在临床样本之前回答了这个问题,答案是肯定的。”
该研究没有提供确凿的证据表明 Omicron 存在于这些城市。废水中存在的病毒是碎片化的,虽然研究人员检测到了 Omicron 的许多明显突变,但这些发现并不能证明它们都存在于同一个基因组上。
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“我认为看到一个新的变种首先出现在像纽约这样的大城市,我认为没有人会感到惊讶,”她说。
来自多个机构的科学家团队——皇后学院的 John Dennehy、皇后区社区学院的 Monica Trujillo、德克萨斯 A&M 大学的 Davida Smyth 和密苏里大学的 Marc Johnson——自今年夏天以来一直在追踪纽约市废水中的冠状病毒。 2020. 该团队通常每周收集样本,然后对他们发现的病毒进行测序。
科学家们于 11 月 21 日收集了一份常规样本,两天后将其送去测序。Dennehy 博士说,当他们在 12 月初得到结果时,Omicron 的消息已经传出,他们“立即认识到”新变体的明显突变。
Boehm 博士的团队在加利福尼亚采取了不同的方法,使用能够检测 Omicron 的某些特定突变的 PCR 测试。Boehm 博士说,他们在 11 月 26 日从前一天在默塞德收集的样本中获得了第一次打击。他们于 11 月 30 日在萨克拉门托收集了另一个样本。
12月1日宣布了美国首例确诊的Omicron病例。
“我们的周转速度非常快,采样频率非常高,”Boehm 博士说。她补充说,“这只是比临床测序更早地提供信息。”
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根据疾病控制与预防中心和全国研究人员的一份新报告, Omicron 可能在美国发现第一例新变种前一周多就存在于纽约市的废水中。
样本表明,纽约市的某人可能早在 11 月 21 日就感染了 Omicron 变体,比南非科学家首次宣布该变体病例早四天,比美国报告第一例病例早十天。加利福尼亚州和德克萨斯州的研究人员还在 11 月下旬的废水样本中发现了 Omicron 的证据。
研究结果表明,当时 Omicron 变体在美国比单独的病例数据所表明的更为普遍,并提供了更多证据表明废水监测可以作为新变体传播的早期预警系统。
“起初,不确定这种变体是否会来到美国,”斯坦福大学的环境工程师、该论文的作者 Alexandria Boehm 说。“废水在临床样本之前回答了这个问题,答案是肯定的。”
该研究没有提供确凿的证据表明 Omicron 存在于这些城市。废水中存在的病毒是碎片化的,虽然研究人员检测到了 Omicron 的许多明显突变,但这些发现并不能证明它们都存在于同一个基因组上。
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“我认为看到一个新的变种首先出现在像纽约这样的大城市,我认为没有人会感到惊讶,”她说。
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科学家们于 11 月 21 日收集了一份常规样本,两天后将其送去测序。Dennehy 博士说,当他们在 12 月初得到结果时,Omicron 的消息已经传出,他们“立即认识到”新变体的明显突变。
Boehm 博士的团队在加利福尼亚采取了不同的方法,使用能够检测 Omicron 的某些特定突变的 PCR 测试。Boehm 博士说,他们在 11 月 26 日从前一天在默塞德收集的样本中获得了第一次打击。他们于 11 月 30 日在萨克拉门托收集了另一个样本。
12月1日宣布了美国首例确诊的Omicron病例。
“我们的周转速度非常快,采样频率非常高,”Boehm 博士说。她补充说,“这只是比临床测序更早地提供信息。”
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废水数据显示,Omicron 可能早在美国发现第一例病例之前就已经在纽约市了
根据疾病控制与预防中心和全国研究人员的一份新报告, Omicron 可能在美国发现第一例新变种前一周多就存在于纽约市的废水中。
样本表明,纽约市的某人可能早在 11 月 21 日就感染了 Omicron 变体,比南非科学家首次宣布该变体病例早四天,比美国报告第一例病例早十天。加利福尼亚州和德克萨斯州的研究人员还在 11 月下旬的废水样本中发现了 Omicron 的证据。
研究结果表明,当时 Omicron 变体在美国比单独的病例数据所表明的更为普遍,并提供了更多证据表明废水监测可以作为新变体传播的早期预警系统。
“起初,不确定这种变体是否会来到美国,”斯坦福大学的环境工程师、该论文的作者 Alexandria Boehm 说。“废水在临床样本之前回答了这个问题,答案是肯定的。”
该研究没有提供确凿的证据表明 Omicron 存在于这些城市。废水中存在的病毒是碎片化的,虽然研究人员检测到了 Omicron 的许多明显突变,但这些发现并不能证明它们都存在于同一个基因组上。
CDC国家废水监测系统项目负责人、《Omicron纸。
“我认为看到一个新的变种首先出现在像纽约这样的大城市,我认为没有人会感到惊讶,”她说。
来自多个机构的科学家团队——皇后学院的 John Dennehy、皇后区社区学院的 Monica Trujillo、德克萨斯 A&M 大学的 Davida Smyth 和密苏里大学的 Marc Johnson——自今年夏天以来一直在追踪纽约市��水中的冠状病毒。 2020. 该团队通常每周收集样本,然后对他们发现的病毒进行测序。
科学家们于 11 月 21 日收集了一份常规样本,两天后将其送去测序。Dennehy 博士说,当他们在 12 月初得到结果时,Omicron 的消息已经传出,他们“立即认识到”新变体的明显突变。
Boehm 博士的团队在加利福尼亚采取了不同的方法,使用能够检测 Omicron 的某些特定突变的 PCR 测试。Boehm 博士说,他们在 11 月 26 日从前一天在默塞德收集的样本中获得了第一次打击。他们于 11 月 30 日在萨克拉门托收集了另一个样本。
12月1日宣布了美国首例确诊的Omicron病例。
“我们的周转速度非常快,采样频率非常高,”Boehm 博士说。她补充说,“这只是比临床测序更早地提供信息。”
Emily Anthes 是《纽约时报》的记者,她专注于科学和健康,涵盖冠状病毒大流行、疫苗接种、病毒检测和儿童 Covid 等主题。
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废水数据显示,Omicron 可能早在美国发现第一例病例之前就已经在纽约市了。
根据疾病控制与预防中心和全国研究人员的一份新报告, Omicron 可能在美国发现第一例新变种前一周多就存在于纽约市的废水中。
样本表明,纽约市的某人可能早在 11 月 21 日就感染了 Omicron 变体,比南非科学家首次宣布该变体病例早四天,比美国报告第一例病例早十天。加利福尼亚州和德克萨斯州的研究人员还在 11 月下旬的废水样本中发现了 Omicron 的证据。
研究结果表明,当时 Omicron 变体在美国比单独的病例数据所表明的更为普遍,并提供了更多证据表明废水监测可以作为新变体传播的早期预警系统。
“起初,不确定这种变体是否会来到美国,”斯坦福大学的环境工程师、该论文的作者 Alexandria Boehm 说。“废水在临床样本之前回答了这个问题,答案是肯定的。”
该研究没有提供确凿的证据表明 Omicron 存在于这些城市。废水中存在的病毒是碎片化的,虽然研究人员检测到了 Omicron 的许多明显突变,但这些发现并不能证明它们都存在于同一个基因组上。
CDC国家废水监测系统项目负责人、《Omicron纸。
“我认为看到一个新的变种首先出现在像纽约这样的大城市,我认为没有人会感到惊讶,”她说。
来自多个机构的科学家团队——皇后学院的 John Dennehy、皇后区社区学院的 Monica Trujillo、德克萨斯 A&M 大学的 Davida Smyth 和密苏里大学的 Marc Johnson——自今年夏天以来一直在追踪纽约市废水中的冠状病毒。 2020. 该团队通常每周收集样本,然后对他们发现的病毒进行测序。
科学家们于 11 月 21 日收集了一份常规样本,两天后将其送去测序。Dennehy 博士说,当他们在 12 月初得到结果时,Omicron 的消息已经传出,他们“立即认识到”新变体的明显突变。
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12月1日宣布了美国首例确诊的Omicron病例。
“我们的周转速度非常快,采样频率非常高,”Boehm 博士说。她补充说,“这只是比临床测序更早地提供信息。”
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样本表明,纽约市的某人可能早在 11 月 21 日就感染了 Omicron 变体,比南非科学家首次宣布该变体病例早四天,比美国报告第一例病例早十天。加利福尼亚州和德克萨斯州的研究人员还在 11 月下旬的废水样本中发现了 Omicron 的证据。
研究结果表明,当时 Omicron 变体在美国比单独的病例数据所表明的更为普遍,并提供了更多证据表明废水监测可以作为新变体传播的早期预警系统。
“起初,不确定这种变体是否会来到美国,”斯坦福大学的环境工程师、该论文的作者 Alexandria Boehm 说。“废水在临床样本之前回答了这个问题,答案是肯定的。”
该研究没有提供确凿的证据表明 Omicron 存在于这些城市。废水中存在的病毒是碎片化的,虽然研究人员检测到了 Omicron 的许多明显突变,但这些发现并不能证明它们都存在于同一个基因组上。
CDC国家废水监测系统项目负责人、《Omicron纸。
“我认为看到一个新的变种首先出现在像纽约这样的大城市,我认为没有人会感到惊讶,”她说。
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科学家们于 11 月 21 日收集了一份常规样本,两天后将其送去测序。Dennehy 博士说,当他们在 12 月初得到结果时,Omicron 的消息已经传出,他们“立即认识到”新变体的明显突变。
Boehm 博士的团队在加利福尼亚采取了不同的方法,使用能够检测 Omicron 的某些特定突变的 PCR 测试。Boehm 博士说,他们在 11 月 26 日从前一天在默塞德收集的样本中获得了第一次打击。他们于 11 月 30 日在萨克拉门托收集了另一个样本。
12月1日宣布了美国首例确诊的Omicron病例。
“我们的周转速度非常快,采样频率非常高,”Boehm 博士说。她补充说,“这只是比临床测序更早地提供信息。”
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Omicron was probably in N.Y.C. well before the first U.S. case was detected, wastewater data suggest.
Omicron was probably in N.Y.C. well before the first U.S. case was detected, wastewater data suggest. By Emily Anthes Jan. 20, 2022 Omicron was probably present in New York City’s wastewater more than a week before the first case of the new variant was detected in the United States, according to a new report from the Centers for Disease Control and Prevention and researchers across the country. The samples suggest that someone in New York City may have had the Omicron variant as early as Nov. 21, four days before South African scientists first announced cases of the variant and ten days before the first U.S. case was reported. Researchers in California and Texas also found evidence of Omicron in wastewater samples from late November. The findings suggest that at the time, the Omicron variant was more widespread in the United States than the case data alone would indicate, and provide more evidence that wastewater surveillance can serve as an early warning system about the spread of new variants. “At first it was uncertain whether this variant was going to come to the United States,” said Alexandria Boehm, an environmental engineer at Stanford and an author of the paper. “The wastewater answered that question way before the clinical samples could, and the answer was yes.” The research does not provide conclusive evidence that Omicron was present in these cities. The virus present in wastewater is fragmented, and while the researchers detected many of Omicron’s telltale mutations, the findings do not prove that they were all present on the same genome. Still, the results are highly suggestive, and are consistent with what scientists have learned about how quickly Omicron spreads and where it was likely to pop up first, said Amy Kirby, the program lead for the C.D.C.’s National Wastewater Surveillance System and an author of the paper. “I don’t think anyone is surprised to see a new variant show up in a major city like New York first,” she said. A team of scientists from several institutions — John Dennehy at Queens College, Monica Trujillo at Queensborough Community College, Davida Smyth at Texas A&M University and Marc Johnson at the University of Missouri — have been tracking the coronavirus in New York City’s wastewater since the summer of 2020. The team typically collects samples weekly and then sequences the virus they find. The scientists collected one of their routine samples on Nov. 21 and sent it for sequencing two days later. By the time they got the results, in early December, the Omicron news had broken, and they “immediately recognized” the new variant’s distinct mutations, Dr. Dennehy said. Dr. Boehm’s team took a different approach in California, using P.C.R. tests capable of detecting some of Omicron’s specific mutations. They got their first hit on Nov. 26, from a sample collected in Merced the previous day, Dr. Boehm said. They got another on a sample collected in Sacramento on Nov. 30. The first confirmed case of Omicron in the U.S. was announced on Dec. 1. “We have really rapid turnaround and really frequent sampling,” Dr. Boehm said. She added, “This just gives information way earlier than clinical sequencing can.” Emily Anthes is a reporter for The New York Times, where she focuses on science and health and covers topics like the coronavirus pandemic, vaccinations, virus testing and Covid in children.
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